Es una lista abierta, sin orden jerárquico, de los subprogramas de interés:

• Plan Metropolitano de Movilidad (en el marco de un plan metropolitano de ordenamiento territorial que incluya propuestas específicas sobre vialidad y transporte de cargas y de pasajeros).
   
• La cuenca del Río Santa Lucía y las cuencas de los arroyos Las Piedras, Carrasco, Pando y Solís.
   
• Plan Metropolitano de hábitat social.
   
• Plan regional de desarrollo ambiental: saneamiento, drenajes, residuos sólidos, áreas naturales protegidas etc.).
   
• Sistema de aprovechamiento de los recursos culturales y educativos en la región.
   
• Plan regional de salud.
   
• Acuerdo para el desarrollo digital del área metropolitana.
   
• Planificación estratégica para el estímulo y la coordinación de las áreas productivas y la logística.
   
• Implementación de medidas integrales de promoción del comercio y el turismo.
   
• Desarrollo de planes generales y parciales de estrategia y gestión territorial integrada y planes de ordenamiento a otras escalas, incluyendo la escala urbana.
   
• Gestión integrada de la faja costera.